Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ATXN3P54252 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms