Protein–RNA interactions for Protein: P53990

IST1, IST1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IST1P53990 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IST1P53990 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IST1P53990 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IST1P53990 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IST1P53990 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IST1P53990 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IST1P53990 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IST1P53990 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IST1P53990 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IST1P53990 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IST1P53990 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IST1P53990 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IST1P53990 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IST1P53990 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IST1P53990 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IST1P53990 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IST1P53990 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IST1P53990 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IST1P53990 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IST1P53990 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IST1P53990 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IST1P53990 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IST1P53990 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IST1P53990 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IST1P53990 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IST1P53990 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IST1P53990 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IST1P53990 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IST1P53990 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IST1P53990 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IST1P53990 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IST1P53990 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IST1P53990 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IST1P53990 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IST1P53990 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IST1P53990 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IST1P53990 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IST1P53990 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IST1P53990 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IST1P53990 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IST1P53990 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IST1P53990 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IST1P53990 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IST1P53990 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IST1P53990 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IST1P53990 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IST1P53990 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IST1P53990 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IST1P53990 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IST1P53990 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IST1P53990 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IST1P53990 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IST1P53990 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IST1P53990 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IST1P53990 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IST1P53990 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IST1P53990 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IST1P53990 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IST1P53990 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IST1P53990 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IST1P53990 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IST1P53990 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IST1P53990 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IST1P53990 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IST1P53990 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IST1P53990 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IST1P53990 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IST1P53990 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IST1P53990 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IST1P53990 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IST1P53990 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IST1P53990 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IST1P53990 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IST1P53990 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IST1P53990 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IST1P53990 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IST1P53990 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IST1P53990 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IST1P53990 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IST1P53990 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IST1P53990 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IST1P53990 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IST1P53990 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IST1P53990 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IST1P53990 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IST1P53990 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IST1P53990 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IST1P53990 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IST1P53990 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IST1P53990 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IST1P53990 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IST1P53990 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IST1P53990 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IST1P53990 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IST1P53990 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IST1P53990 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IST1P53990 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IST1P53990 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IST1P53990 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IST1P53990 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms