Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DAP3P51398 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DAP3P51398 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DAP3P51398 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DAP3P51398 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DAP3P51398 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DAP3P51398 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DAP3P51398 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DAP3P51398 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DAP3P51398 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DAP3P51398 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DAP3P51398 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DAP3P51398 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DAP3P51398 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DAP3P51398 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DAP3P51398 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DAP3P51398 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DAP3P51398 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DAP3P51398 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DAP3P51398 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DAP3P51398 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DAP3P51398 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DAP3P51398 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DAP3P51398 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DAP3P51398 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DAP3P51398 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DAP3P51398 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DAP3P51398 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DAP3P51398 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DAP3P51398 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DAP3P51398 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DAP3P51398 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DAP3P51398 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DAP3P51398 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DAP3P51398 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DAP3P51398 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DAP3P51398 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DAP3P51398 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DAP3P51398 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DAP3P51398 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DAP3P51398 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DAP3P51398 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DAP3P51398 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DAP3P51398 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DAP3P51398 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DAP3P51398 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DAP3P51398 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DAP3P51398 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DAP3P51398 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DAP3P51398 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DAP3P51398 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DAP3P51398 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DAP3P51398 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DAP3P51398 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DAP3P51398 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DAP3P51398 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DAP3P51398 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DAP3P51398 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DAP3P51398 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DAP3P51398 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DAP3P51398 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DAP3P51398 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DAP3P51398 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DAP3P51398 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DAP3P51398 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DAP3P51398 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DAP3P51398 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DAP3P51398 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DAP3P51398 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DAP3P51398 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DAP3P51398 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DAP3P51398 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DAP3P51398 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DAP3P51398 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DAP3P51398 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DAP3P51398 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DAP3P51398 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DAP3P51398 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DAP3P51398 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DAP3P51398 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DAP3P51398 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DAP3P51398 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DAP3P51398 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DAP3P51398 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DAP3P51398 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DAP3P51398 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DAP3P51398 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DAP3P51398 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DAP3P51398 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DAP3P51398 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DAP3P51398 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DAP3P51398 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DAP3P51398 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DAP3P51398 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DAP3P51398 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DAP3P51398 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DAP3P51398 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DAP3P51398 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DAP3P51398 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DAP3P51398 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms