Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms