Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD52P43351 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD52P43351 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD52P43351 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD52P43351 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD52P43351 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD52P43351 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD52P43351 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD52P43351 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD52P43351 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD52P43351 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD52P43351 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD52P43351 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD52P43351 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD52P43351 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD52P43351 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD52P43351 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD52P43351 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD52P43351 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD52P43351 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD52P43351 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD52P43351 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD52P43351 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD52P43351 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD52P43351 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD52P43351 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD52P43351 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD52P43351 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAD52P43351 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAD52P43351 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAD52P43351 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD52P43351 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD52P43351 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD52P43351 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD52P43351 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD52P43351 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD52P43351 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD52P43351 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD52P43351 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD52P43351 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD52P43351 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD52P43351 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD52P43351 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD52P43351 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD52P43351 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD52P43351 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD52P43351 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD52P43351 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD52P43351 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD52P43351 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD52P43351 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD52P43351 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD52P43351 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD52P43351 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD52P43351 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD52P43351 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD52P43351 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD52P43351 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD52P43351 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD52P43351 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD52P43351 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD52P43351 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD52P43351 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD52P43351 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD52P43351 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD52P43351 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD52P43351 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD52P43351 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD52P43351 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD52P43351 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD52P43351 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD52P43351 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD52P43351 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD52P43351 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD52P43351 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD52P43351 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD52P43351 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD52P43351 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD52P43351 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD52P43351 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD52P43351 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD52P43351 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD52P43351 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD52P43351 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD52P43351 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD52P43351 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD52P43351 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD52P43351 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD52P43351 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD52P43351 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD52P43351 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD52P43351 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD52P43351 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD52P43351 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD52P43351 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD52P43351 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD52P43351 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD52P43351 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD52P43351 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD52P43351 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms