Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL35P42766 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL35P42766 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL35P42766 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL35P42766 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL35P42766 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL35P42766 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL35P42766 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL35P42766 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL35P42766 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL35P42766 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL35P42766 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL35P42766 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL35P42766 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL35P42766 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL35P42766 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL35P42766 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL35P42766 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL35P42766 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPL35P42766 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL35P42766 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL35P42766 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL35P42766 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL35P42766 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL35P42766 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL35P42766 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL35P42766 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL35P42766 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL35P42766 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL35P42766 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL35P42766 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL35P42766 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL35P42766 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL35P42766 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL35P42766 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL35P42766 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL35P42766 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL35P42766 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL35P42766 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL35P42766 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL35P42766 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL35P42766 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL35P42766 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL35P42766 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL35P42766 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL35P42766 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL35P42766 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL35P42766 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL35P42766 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL35P42766 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL35P42766 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL35P42766 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL35P42766 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL35P42766 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL35P42766 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL35P42766 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL35P42766 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL35P42766 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL35P42766 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL35P42766 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL35P42766 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL35P42766 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL35P42766 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL35P42766 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL35P42766 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL35P42766 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL35P42766 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL35P42766 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL35P42766 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL35P42766 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL35P42766 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL35P42766 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL35P42766 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL35P42766 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL35P42766 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL35P42766 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL35P42766 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL35P42766 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL35P42766 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL35P42766 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL35P42766 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL35P42766 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL35P42766 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL35P42766 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL35P42766 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL35P42766 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL35P42766 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL35P42766 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL35P42766 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL35P42766 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL35P42766 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL35P42766 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL35P42766 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL35P42766 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL35P42766 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL35P42766 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL35P42766 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL35P42766 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL35P42766 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL35P42766 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms