Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN2P35609 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACTN2P35609 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms