Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MIPP30301 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MIPP30301 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MIPP30301 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MIPP30301 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MIPP30301 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIPP30301 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MIPP30301 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIPP30301 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIPP30301 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIPP30301 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIPP30301 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIPP30301 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIPP30301 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIPP30301 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIPP30301 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIPP30301 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIPP30301 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIPP30301 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIPP30301 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIPP30301 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIPP30301 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIPP30301 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIPP30301 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIPP30301 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIPP30301 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIPP30301 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIPP30301 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIPP30301 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIPP30301 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIPP30301 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIPP30301 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIPP30301 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIPP30301 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIPP30301 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIPP30301 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIPP30301 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIPP30301 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIPP30301 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIPP30301 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIPP30301 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MIPP30301 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MIPP30301 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MIPP30301 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MIPP30301 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIPP30301 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIPP30301 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIPP30301 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIPP30301 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIPP30301 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIPP30301 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIPP30301 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIPP30301 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIPP30301 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIPP30301 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIPP30301 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIPP30301 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIPP30301 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIPP30301 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIPP30301 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIPP30301 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIPP30301 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MIPP30301 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MIPP30301 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MIPP30301 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MIPP30301 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MIPP30301 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MIPP30301 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MIPP30301 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIPP30301 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIPP30301 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIPP30301 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIPP30301 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIPP30301 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIPP30301 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIPP30301 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIPP30301 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MIPP30301 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIPP30301 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIPP30301 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIPP30301 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MIPP30301 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MIPP30301 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MIPP30301 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MIPP30301 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MIPP30301 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MIPP30301 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MIPP30301 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MIPP30301 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MIPP30301 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MIPP30301 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIPP30301 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIPP30301 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIPP30301 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIPP30301 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIPP30301 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIPP30301 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIPP30301 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIPP30301 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIPP30301 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms