Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGA3P0DJD8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGA3P0DJD8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGA3P0DJD8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGA3P0DJD8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGA3P0DJD8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGA3P0DJD8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGA3P0DJD8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGA3P0DJD8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGA3P0DJD8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGA3P0DJD8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGA3P0DJD8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGA3P0DJD8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGA3P0DJD8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGA3P0DJD8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGA3P0DJD8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGA3P0DJD8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGA3P0DJD8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PGA3P0DJD8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PGA3P0DJD8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PGA3P0DJD8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PGA3P0DJD8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGA3P0DJD8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGA3P0DJD8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGA3P0DJD8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGA3P0DJD8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGA3P0DJD8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGA3P0DJD8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGA3P0DJD8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGA3P0DJD8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGA3P0DJD8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGA3P0DJD8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGA3P0DJD8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGA3P0DJD8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGA3P0DJD8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGA3P0DJD8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGA3P0DJD8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGA3P0DJD8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGA3P0DJD8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGA3P0DJD8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGA3P0DJD8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGA3P0DJD8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PGA3P0DJD8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGA3P0DJD8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGA3P0DJD8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGA3P0DJD8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms