Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD7

PGA4, Pepsin A-4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA4P0DJD7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGA4P0DJD7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGA4P0DJD7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGA4P0DJD7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGA4P0DJD7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGA4P0DJD7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGA4P0DJD7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGA4P0DJD7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGA4P0DJD7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PGA4P0DJD7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PGA4P0DJD7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PGA4P0DJD7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGA4P0DJD7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms