Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALB1P05937 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALB1P05937 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALB1P05937 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALB1P05937 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CALB1P05937 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALB1P05937 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALB1P05937 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALB1P05937 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALB1P05937 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALB1P05937 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALB1P05937 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALB1P05937 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALB1P05937 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALB1P05937 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALB1P05937 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALB1P05937 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALB1P05937 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALB1P05937 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALB1P05937 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALB1P05937 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALB1P05937 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALB1P05937 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALB1P05937 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALB1P05937 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CALB1P05937 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALB1P05937 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALB1P05937 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALB1P05937 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALB1P05937 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALB1P05937 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALB1P05937 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALB1P05937 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALB1P05937 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALB1P05937 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALB1P05937 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALB1P05937 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALB1P05937 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CALB1P05937 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALB1P05937 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALB1P05937 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALB1P05937 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALB1P05937 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALB1P05937 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALB1P05937 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALB1P05937 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALB1P05937 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALB1P05937 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALB1P05937 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALB1P05937 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALB1P05937 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALB1P05937 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALB1P05937 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALB1P05937 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALB1P05937 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CALB1P05937 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CALB1P05937 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CALB1P05937 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALB1P05937 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALB1P05937 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALB1P05937 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALB1P05937 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALB1P05937 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALB1P05937 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALB1P05937 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALB1P05937 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALB1P05937 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALB1P05937 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALB1P05937 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALB1P05937 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALB1P05937 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALB1P05937 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALB1P05937 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALB1P05937 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALB1P05937 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALB1P05937 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALB1P05937 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALB1P05937 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALB1P05937 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALB1P05937 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALB1P05937 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALB1P05937 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALB1P05937 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALB1P05937 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALB1P05937 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALB1P05937 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALB1P05937 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALB1P05937 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CALB1P05937 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALB1P05937 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALB1P05937 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALB1P05937 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALB1P05937 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALB1P05937 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALB1P05937 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALB1P05937 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALB1P05937 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALB1P05937 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALB1P05937 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALB1P05937 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms