Protein–RNA interactions for Protein: O75167

PHACTR2, Phosphatase and actin regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR2O75167 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHACTR2O75167 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHACTR2O75167 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms