Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A8MVJ9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A8MVJ9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A8MVJ9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A8MVJ9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A8MVJ9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A8MVJ9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A8MVJ9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A8MVJ9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A8MVJ9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A8MVJ9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
A8MVJ9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
A8MVJ9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A8MVJ9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A8MVJ9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
A8MVJ9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A8MVJ9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A8MVJ9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A8MVJ9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A8MVJ9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A8MVJ9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A8MVJ9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
A8MVJ9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A8MVJ9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A8MVJ9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A8MVJ9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
A8MVJ9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A8MVJ9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A8MVJ9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A8MVJ9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A8MVJ9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A8MVJ9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A8MVJ9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A8MVJ9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
A8MVJ9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A8MVJ9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A8MVJ9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A8MVJ9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
A8MVJ9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
A8MVJ9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A8MVJ9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A8MVJ9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A8MVJ9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A8MVJ9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A8MVJ9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A8MVJ9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A8MVJ9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A8MVJ9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A8MVJ9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A8MVJ9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A8MVJ9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A8MVJ9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A8MVJ9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A8MVJ9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A8MVJ9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A8MVJ9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A8MVJ9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A8MVJ9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A8MVJ9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A8MVJ9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A8MVJ9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A8MVJ9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A8MVJ9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
A8MVJ9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
A8MVJ9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
A8MVJ9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
A8MVJ9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A8MVJ9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A8MVJ9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A8MVJ9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A8MVJ9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A8MVJ9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
A8MVJ9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
A8MVJ9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A8MVJ9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A8MVJ9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A8MVJ9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A8MVJ9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A8MVJ9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A8MVJ9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A8MVJ9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A8MVJ9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A8MVJ9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A8MVJ9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A8MVJ9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A8MVJ9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A8MVJ9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A8MVJ9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
A8MVJ9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A8MVJ9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
A8MVJ9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A8MVJ9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A8MVJ9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A8MVJ9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A8MVJ9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A8MVJ9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A8MVJ9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A8MVJ9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A8MVJ9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A8MVJ9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms