Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ11

PMS2P5, Postmeiotic segregation increased 2-like protein 5, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P5A8MQ11 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P5A8MQ11 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P5A8MQ11 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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