Protein–RNA interactions for Protein: A6NDY0

PABPN1L, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1LA6NDY0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PABPN1LA6NDY0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms