Protein–RNA interactions for Protein: A6NCS4

NKX2-6, Homeobox protein Nkx-2.6, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-6A6NCS4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NKX2-6A6NCS4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-6A6NCS4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms