Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC162PA2VCL2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms