Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPDC1A2A3K4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms