Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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