Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms