Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TSPAN18Q96SJ8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms