Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms