Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms