Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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