Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms