Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms