Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms