Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FAM3BP58499 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms