Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ME1P48163 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ME1P48163 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ME1P48163 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ME1P48163 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms