Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDI1P31150 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDI1P31150 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDI1P31150 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GDI1P31150 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDI1P31150 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDI1P31150 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDI1P31150 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDI1P31150 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDI1P31150 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDI1P31150 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDI1P31150 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDI1P31150 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDI1P31150 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDI1P31150 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDI1P31150 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDI1P31150 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GDI1P31150 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDI1P31150 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDI1P31150 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDI1P31150 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDI1P31150 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDI1P31150 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDI1P31150 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDI1P31150 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDI1P31150 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDI1P31150 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDI1P31150 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDI1P31150 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDI1P31150 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDI1P31150 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDI1P31150 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms