Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms