Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAPLNO95428 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms