Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SEC22BO75396 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SEC22BO75396 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SEC22BO75396 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SEC22BO75396 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SEC22BO75396 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SEC22BO75396 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SEC22BO75396 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SEC22BO75396 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SEC22BO75396 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SEC22BO75396 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SEC22BO75396 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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