Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms