Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN2Q9UNF0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms