Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD8

UBE2T, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2TQ9NPD8 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2TQ9NPD8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2TQ9NPD8 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms