Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms