Protein–RNA interactions for Protein: Q8N129

CNPY4, Protein canopy homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY4Q8N129 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 ALDH8A1-203ENST00000367845 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNPY4Q8N129 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPY4Q8N129 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms