Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL22Q53GT1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms