Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 COA4-201ENST00000355693 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 SCARNA7-201ENST00000458797 330 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 AC245519.2-201ENST00000633673 475 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01559Q495D7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms