Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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