Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FXNQ16595 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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FXNQ16595 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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FXNQ16595 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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FXNQ16595 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FXNQ16595 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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