Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms