Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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