Protein–RNA interactions for Protein: Q03052

POU3F1, POU domain, class 3, transcription factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F1Q03052 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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POU3F1Q03052 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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POU3F1Q03052 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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POU3F1Q03052 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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POU3F1Q03052 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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POU3F1Q03052 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POU3F1Q03052 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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