Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APBA1Q02410 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms