Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms