Protein–RNA interactions for Protein: P29074

PTPN4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4P29074 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN4P29074 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms