Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD247P20963 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD247P20963 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD247P20963 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD247P20963 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CD247P20963 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD247P20963 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD247P20963 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD247P20963 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD247P20963 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD247P20963 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD247P20963 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CD247P20963 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms