Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms